Detalhe da pesquisa
1.
MCM complexes are barriers that restrict cohesin-mediated loop extrusion.
Nature
; 606(7912): 197-203, 2022 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-35585235
2.
A central role for canonical PRC1 in shaping the 3D nuclear landscape.
Genes Dev
; 34(13-14): 931-949, 2020 07 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32439634
3.
Ultra-long-range interactions between active regulatory elements.
Genome Res
; 33(8): 1269-1283, 2023 08.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-37451823
4.
Bioframe: operations on genomic intervals in Pandas dataframes.
Bioinformatics
; 40(2)2024 Feb 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38402507
5.
Cooltools: Enabling high-resolution Hi-C analysis in Python.
PLoS Comput Biol
; 20(5): e1012067, 2024 May 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38709825
6.
Single-nucleus Hi-C reveals unique chromatin reorganization at oocyte-to-zygote transition.
Nature
; 544(7648): 110-114, 2017 04 06.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28355183
7.
Trisomies Reorganize Human 3D Genome.
Int J Mol Sci
; 24(22)2023 Nov 07.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-38003233
8.
Developmentally regulated Shh expression is robust to TAD perturbations.
Development
; 146(19)2019 09 30.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31511252
9.
A mechanism of cohesin-dependent loop extrusion organizes zygotic genome architecture.
EMBO J
; 36(24): 3600-3618, 2017 12 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-29217590
10.
Coolpup.py: versatile pile-up analysis of Hi-C data.
Bioinformatics
; 36(10): 2980-2985, 2020 05 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32003791
11.
C-TALE, a new cost-effective method for targeted enrichment of Hi-C/3C-seq libraries.
Methods
; 170: 48-60, 2020 01 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-31252062
12.
Bivalent promoter hypermethylation in cancer is linked to the H327me3/H3K4me3 ratio in embryonic stem cells.
BMC Biol
; 18(1): 25, 2020 03 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32131813
13.
Low Level of Expression of C-Terminally Truncated Human FUS Causes Extensive Changes in the Spinal Cord Transcriptome of Asymptomatic Transgenic Mice.
Neurochem Res
; 45(5): 1168-1179, 2020 May.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-32157564
14.
Quantitative differences in TAD border strength underly the TAD hierarchy in Drosophila chromosomes.
J Cell Biochem
; 120(3): 4494-4503, 2019 03.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-30260021
15.
Active chromatin and transcription play a key role in chromosome partitioning into topologically associating domains.
Genome Res
; 26(1): 70-84, 2016 Jan.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-26518482
16.
Evolution of the Genome 3D Organization: Comparison of Fused and Segregated Globin Gene Clusters.
Mol Biol Evol
; 34(6): 1492-1504, 2017 06 01.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-28333290
17.
Pairtools: from sequencing data to chromosome contacts.
bioRxiv
; 2023 Feb 15.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36824968
18.
Cohesin is required for long-range enhancer action at the Shh locus.
Nat Struct Mol Biol
; 29(9): 891-897, 2022 09.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-36097291
19.
From bedside to bench: regulation of host factors in SARS-CoV-2 infection.
Exp Mol Med
; 53(4): 483-494, 2021 04.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-33828231
20.
Nuclear organisation and replication timing are coupled through RIF1-PP1 interaction.
Nat Commun
; 12(1): 2910, 2021 05 18.
Artigo
em Inglês
| MEDLINE | ID: mdl-34006872